Primeiramente devemos entender que o modulo MANIFESTO DO DESTINATÁRIO é uma ferramenta espelho já disponibilizado pelo próprio SEFAZ.
A disponibilidade das notas no sistema depende totalmente do SEFAZ e por seu meio de comunicação, caso ocorra erros na comunicação não será exibido no sistema e não tem recursos para suporte
Alguns motivos que pode ocorrer esse incidente.
- Sefaz com instabilidade ou fora do ar
- Emitente da nota não autorizou o manifesto
- Outra aplicação fazer a mesma função, ou seja, baixando os xml. A contabilidade geralmente tem essa aplicação.
- Muitas consultas ou downloads por hora. Sefaz permite uma consulta por hora e baixar 20 xml por hora
As notas pode fazer a entrada normalmente usando so o xml ou a chave. Veja o artigo abaixa
https://suporte.proenza.com.br/docs/entrada-de-nota-usando-xml-sistema-digisat
Segue abaixo o site SEFAZ , módulo manifesto do destinatário (OBS: para fazer a consulta tem que ter certificado digital instalado):
Portal da Nota Fiscal Eletrônica (fazenda.gov.br)

Selecione a opção NÃO TENHO A CHAVE DE ACESSO

Sem manifesto é esta disponivel.
Confirmado a ciencia da operação, essa nota ja foi baixado por outro local, então pode ocorrer de não disponibilizar no sistema

Caso ainda não esteja disponível a nota consulte pela chave de acesso, volte para a página inicial e clique em CONSULTAR NF-e

Digite a chave de acesso da nota, após conseguir consultar você pode baixar o arquivo XML e importar para o sistema.

pode acontecer em alguns casos de aparecer a mensagem abaixo, e para estes casos o que resta é entrar em contato com quem emitiu a nota para te enviar o arquivo XML da nota fiscal.
